Para entender assinatura digital vamos à algumas definições:

Assinatura
Ato de aceitar e comprometer-se;
Sinal distinto e exclusivo de uma pessoa;
Atesta o autor e sua vontade;

Certificado Digital
Documento Eletrônico que identifica a pessoa (ou empresa) e possui a chave pública embutida

Assinatura Digital
Sinal eletrônico único e exclusivo que identifica uma pessoa que manifestou uma vontade ou compromisso em um documento eletrônico. Atrelado a um Certificado Digital.

A boa notícia em relação à documento eletrônico e assinaturas digitais é a regulamentação ocorrida com a medida provisória 2200/02 que institui o documento eletrônico assinado digitalmente como um documento legal.